Center for Interdisciplinary Research CRI Paris Liliane Bettencourt, Frontières du Vivant FdV Life Sciences PhD program, Interdisciplinary Approaches to Life Science AIV Master program. http://www.aiv-paris.org Wed, 19 Jun 2013 08:28:16 +0100 FeedCreator 1.7.2 http://www.aiv-paris.org/images/M_images/joomla_rss.png http://www.aiv-paris.org Center for Interdisciplinary Research CRI Paris Liliane Bettencourt, Frontières du Vivant FdV Life Sciences PhD program, Interdisciplinary Approaches to Life Science AIV Master program. http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/actualites/quand-les-gribouillis-remportent-des-prix.html Les étudiants du club « Draw Me Why ? » du Centre de Recherches Interdisciplinaires remportent le concours vidéo sur le thème « Promouvoir les femmes dans les milieux scientifiques », lancé à l'occasion du European Gender Summit 2012 (http://www.gender-summit.eu/) organisé à Bruxelles. vidéo (https://www.youtube.com/watch?v=ZhzPNE0-bQo)). Le sommet s'est tenu les 29 et 30 Novembre à Bruxelles et promeut l'égalité des sexes dans les milieux scientifiques. La précédente vidéo promotionnelle publiée par la Commission Européenne avait déclenchée l'ire de l'ensemble de la communauté scientifique par son caractère déplacé, et ce concours visait à trouver une vidéo de remplacement (vidéo précédente ici (https://www.youtube.com/watch?v=g032MPrSjFA)). Les Doodle videos sont des croquis dynamiques complétés par une voix off qui peut être traduite en n'importe quelle langue. Le club « Draw Me Why ? » souhaite, à travers des vidéos courtes et explicatives diffusées librement sur internet, rendre la science accessible à tous et en faire un nouvel outil pédagogique pour rétablir le dialogue entre science et éducation. « Car un bon croquis vaut mieux qu'un long discours ».Voir l'article du journal Le Monde sur ce sujet (http://www.lemonde.fr/sciences/article/2012/12/07/des-videos-pour-inciter-les-filles-a-faire-des-sciences_1801341_1650684.html). accueil cri - Actualités Tue, 04 Dec 2012 01:00:00 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/actualites/vicky-colbert-visits-the-cri.html François TADDEI welcomed Vicky COLBERT at the Center for Research and Interdisciplinarity (CRI) on September 21st 2012, as a follow-up to the workshop Learning Through Research (http://www.nightscience.org/) , which took place at the CRI from July 13th to July 15th, 2012. Vicky COLBERT, former Vice-Minister of Education for Colombia, and then UNICEF's Regional Adviser for Education in the Americas, changed her country's educational system by creating the model Escuela Nueva in the 1970s. Based on a will to reduce disparities in school learning between rural and urban areas, the new school is now the educational model applied to the whole country, and has worked as an inspirational model in 40 countries. Currently, it is through the Fundación Escuela Nueva, NGO created in 1987, that the new school is developing. Driven by innovation, this development may produce a partnership with IDEFI's project in order to implement projects on science, and create digital contents, it may even come to building a CRI in Colombia. Vicky COLBERT and François TADDEI will meet again at the The World Innovation Summit for Education (WISE) (http://www.wise-qatar.org/) from November 13th to 15th, 2012 in Doha, Qatar. For more information about Fundación Escuela Nueva's projects: www.escuelanueva.org (http://www.escuelanueva.org)M.K. accueil cri - Actualités Wed, 31 Oct 2012 01:00:00 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/actualites/the--cri-discovery-days---october-15-16-2012.html PROGRAM OF THE CRI DISCOVERY DAYS 2012 Mon Oct 15th 9:00-9:15 Introduction to the Discovery Days 9:15-10:15 Guest talk: Roberto Toro, Institut Pasteur, Paris 10:15-10:30 Movie: Documentary on L-FdV pedagogy Trailer, by Aurélien Peilloux 10:30-10:45 Coffee 10:45-12:00: Walking posters and internships market 12:00-13:30 Lunch 13:30-15:30 Clubs presentations- Existing CRI scientific clubs present their activities and projects.- Presentation of new clubs projects 15:30-16:00 Coffee 16:00-17h00 Guest talk: Cedric Villani, Institut Poincaré, Paris, Fields medal 2010 17:00-18:30 Split sessions -Doctoral school FDV: * academic program, expectations, procedures, renewal of the school accreditation and AERES, candidatures for new representatives, alumni association, etc... * presentations and contacts between different ED FdV classes-Bachelor+Master (L-FdV/M1/M2 AIV ): This is in your hands! each year's students L1/L2/M1/M2 are responsible to animate 20 minutes of the session for the rest of the students. All goes - make the best of your time together! accueil cri - Actualités Fri, 12 Oct 2012 16:23:48 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/actualites/france-3---ce-soir-ou-jamais---speciale-education..html Emission du Mardi 25 septembre 2012 Cette semaine, Frédéric Taddéï propose une revue de presse Spéciale éducation et abordera les thèmes suivants : Est-ce que l'école est obsolète ? Court-circuitée par la télévision et internet, comment peut-elle résister ? ; Profs/Élèves, ascenseur social, prolétarisation des profs : Peut-on se hisser au dessus de sa condition ? ; Morale laïque : l'Etat est il là pour nous faire la morale ? ; L'enseignement est-il idéologisé ? . http://ce-soir-ou-jamais.france3.fr/ (http://ce-soir-ou-jamais.france3.fr/) accueil cri - Actualités Mon, 24 Sep 2012 18:34:54 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/actualites/night-science---learning-through-research-workshop-13-15-july-2012.html 9/7/2012The official launch of the Institute for Innovating Teaching through Research ('IIFR', see below ) project will be marked by an inaugural workshop, 13-15th of July 2012 in the presence of multiple stakeholders, internationally recognized for their contributions within their respective disciplines (science, social entrepreneurship...) as well as for their innovation in education. We particularly welcome Lee Hartwell, winner of the 2001 Nobel Prize for Physiology or Medicine and now instigating an innovative teachers' training program in the United States.AFTER THE EVENT UPDATE : all The 2012 event was sponsored by Fleur Pellerin, French Minister of Small and Medium Enterprises, innovation and digital technologies.Discover: the summarythe pictures the tweets eventsthe videosthe articles realized about the workshopofficial website : nightscience.org (http://www.nightscience.org)This gathering of exceptional individuals has two main objectives. First, it will allow the dissemination of best practices in terms of pedagogy and innovation in educationDuring the first two days we will be exposed to state of the art examples of open science blended with Learning through Research approaches. The second objective is to develop future initiatives to emerge within the IIFR project, co-constructed between the IIFR team and the expert invitees. Thus, July 15th will be devoted to brainstorming in small groups, centered on the main themes of the IIFR project We expect that this intensive three-days workshop will serve as strong basis for the implementation of best practices and newly-born projects as a robust basis to achieve the main goal of the IIFR project: research-based training for students and teachers who will integrate science, new technologies and new pedagogies. PROGRAM FRIDAY 13th JULY 16:00 - Official Opening 17.00 - New perspectives on knowledge co-construction Lee Hartwell, Stephen Friend, Nathalie Kuldell, François Taddei accueil cri - Actualités Mon, 09 Jul 2012 01:00:00 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/master-aiv/master-cat/aiv-master-open-doors-01.06.12-17h00-at-the-cri-paris.html All interested students for a 2012/2013 Master 1 or Master 2 in our AIV Master program are welcome to join us ! AIV Master Open Doors at the CRI, on Friday June 1st at 17:00.You'll be able to meet some teachers and students.Centre de Recherches interdisciplinairesMaster Recherche Approches Interdisciplinaires du Vivant Faculté de médecine Cochin, 2nd floor, room 2006 24 rue du faubourg Saint-Jacques75014 Paris - France(M°6: Saint Jacques or RER B: Port-Royal) Students who are not available may contact us by mail for setting up an informal Skype phone call with our mentors any other day. The online application form is open until June 15th 2012 at midnight. Master AIV - master cat Thu, 24 May 2012 10:39:19 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/education-x.0/francois-taddei-a-la-fondation-telecom-03.05.2012---comment-creer-des-organisations-apprenantes-.html Petit-déjeuner débat en vidéo organisé par la Fondation de l'Institut Télécom pour la formation, la recherche et l'innovation le 3 mai 2012 sur le thème Comment créer des organisations apprenantes ? autour de François TaddeiPrésentation : Les mouvements d'ouverture qui ont caractérisé le web (open source, open innovation, open data, open science, open education) ne concernent plus seulement une avant garde de programmeurs idéalistes. Ils ont donné naissance, notamment sur les campus américains, à une nouvelle culture de la transmission, de l'apprentissage et de l'innovation. Ils bouleversent aujourd'hui jusqu'aux organisations les plus rigoureuses, y compris la recherche scientifique. De nombreuses activités il y a peu très élitistes, doivent désormais apprendre à s'adresser au plus grand nombre et à puiser dans la force créatrice de ce grand nombre. Cette tendance concerne aussi bien l'enseignement et la recherche que l'entreprise. Elle prend une importance accrue avec la montée en puissance des pays émergents, qui démultiplie la puissance de recherche et d'innovation sur la planète. Elle entraîne des changements irréversibles, qui peuvent être mis en oeuvre avec méthode et système. François Taddei, chercheur, fondateur de nombreux dispositifs innovants d'enseignement, de recherche ou de travail avec la jeunesse des quartiers en difficulté, partagera avec nous sa vision et ses expériences.Visionner la vidéo (1h24) sur le site de la Fondation Telecom :http://www.fondation-telecom.org/actualites/petit-déjeuner-débat-en-vidéo-131/ (http://www.fondation-telecom.org/actualites/petit-déjeuner-débat-en-vidéo-131/) accueil cri - Education X.0 Thu, 10 May 2012 11:39:08 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/education-x.0/francois-taddei-aux--jies-2012--les-jeux-comme-point-de-rencontre-entre-recherche-et-education.html JIES 2012 : les jeux dans l'éducation et la médiation scientifiquesLes 2 et 3 mai 2012, l'Espace des Sciences Pierre-Gilles de Gennes accueillait la première journée d'études sur les jeux dans la médiation et l'éducation scientifiques. Destinées aux professionnels de l'éducation, de la médiation et de la communication des sciences, ces journées étaient axées vers la réflexion sur le rapport entre sciences, techniques, apprentissages et jeux. Nous nous sommes interrogés sur ce qui rapproche et différencie le jeu et la pratique scientifique, mais également sur les manières de rendre les apprentissages ludiques, dans la perspective de les rendre plus performants.Programme des JIES 2012 : http://storify.com/nicolasloubet/jies-paris-programme-des-jies-2012-a-l-espggsur Twitter : #JIES_Paris.Intervention de François Taddei le 2 mai aux JIES Paris : Les jeux comme point de rencontre entre recherche et éducationTwitter, compte rendu, photos sur le site des JIES 2012 : https://sites.google.com/site/jiesparis2012/home accueil cri - Education X.0 Thu, 10 May 2012 12:33:46 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/education-x.0/francois-taddei--reinventing-learning-through-research--congress-unplugged-20.04.2012.html SAGE BIONETWORKS COMMONS CONGRESS, San Francisco April 20-21 2012 François taddei was a guest speaker during the 3rd Sage Bionetworks Commons Congress (http://sagecongress.org/) held in San Francisco, April 20-21, 2012.As part of the Commons Congress tradition of Friday evening events that are informative and fun as well as a chance to eat, drink and network, Sage Bionetworks, Rock Health and Ashoka hosted Congress Unplugged! on Friday April 20, 2012. Congress Unplugged! was a venue for participants to share their passion, new ideas, and inspiring stories on the topic of data sharing and collaborative research. Congress Unplugged! talks are short. Speakers focused on a single unique story and challenged the audience to think big suggesting brilliant solutions as well as warning about impeding doom. Congress Unplugged! talks will be posted on the web shortly after the Congress. Think TEDx talks gone viral! Francois Taddei : Reinventing learning through research @ Congress Unplugged ! WATCH FULL PROGRAM (7'14) : http://fora.tv/2012/04/20/Congress_Unplugged_Francois_Taddei (http://fora.tv/2012/04/20/Congress_Unplugged_Francois_Taddei) SummaryLearning through research is a powerful educational tool that is often limited to students in research universities. Can open science, open technology, and open education converge as a force to democratize and reinvent how learning through research is done? i willl give an example of ways forward that i would like to co-design with the sage community. BIO Francois Taddei François Taddei heads the Evolutionary Systems Biology team at a unit of the French National Institute of Health Medical Research (INSERM) in Paris-Descartes University's Medical School. After a generalist scientific education, with majors in physics and biology at the École Polytechnique, he became a tenured higher civil servant at the French Ministry of Agriculture, before earning a PhD in genetics, studying the molecular causes and evolutionary consequences of changes in the mutation rate with Miroslav Radman. After postdoctoral training with John Maynard-Smith where he modeled the evolution of mutation rate, for the last 12 years, his research team has been studying the evolution and molecular mechanisms of cooperation, genetic changes, errors in gene expression, pathogenicity, antibiotic resistance and aging in E. coli. He pioneered the study of aging in this model bacteria and is trying to unravel its mechanisms using microfluidics and systems biology approaches. This work has produced many publications in generalist scientific journals, and has been recognized by several awards, (the European Young Investigator award, the Human Frontier Science Program award, the INSERM Award for Fundamental Research, and the Liliane Bettencourt Life Science Award). accueil cri - Education X.0 Mon, 07 May 2012 01:00:00 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/education-x.0/francois-taddei-aux-journees-de-linnovation-28-mars--unesco.html Enseignants, chefs d'établissement, directeurs, formateurs, inspecteurs, partenaires de l'Ecole... sont accueillis pour les journées de l'innovation les 28 et 29 mars 2012 à l'UNESCO.NEW! Vidéo Knowtex Les Journées de l'innovation avec François Taddei (http://www.knowtex.com/nav/les-journees-de-l-innovation-avec-francois-taddei_33507)Garry Kasparov (docs/Programme_livret-KASPAROV.pdf) et François Taddei (docs/Programme_livret-TADDEI.pdf), le cycle de conférences voit se succéder des chercheurs de rang international et des responsables de haut niveau du secteur éducatif, de la jeunesse et du monde économique parmi lesquels Edgar Morin, Marie-Jeanne Philippe, Romuald Normand et Martin Hirsch.Conférences et focus sont accessibles à tous, à distance, via l'internet et Twitter.Une vingtaine de projets sont exposés dans un « Boulevard des innovations » ; une dizaine d'autres seront analysés et permettront de nourrir l'échange entre enseignants, responsables, chercheurs, également partenaires de l'École.Enfin, cinq prix seront remis aux projets les plus innovants : le prix du public, le prix Edgar Morin, le prix du partenariat, le prix des usagers et un prix consacré à l'évaluation.Consultez le programme des journées (http://media.eduscol.education.fr/file/Journees_innovation/07/2/EducationInnovation_programme_web_211072.pdf), qui propose 5 thématiques : - Tout le monde est concerné : pour une approche systémique du changement- Le cadre bouge : changements dans les pratiques professionnelles et les organisations- Nous observons : enquête sur les pratiques, ingénieries variées et autoévaluation- Nous apprenons : évolution des métiers et développement professionnel- Ça marche ! Effets, résultats, acquis et impacts de l'innovationLes sessions étaient diffusées en live (http://www.cndp.fr/innovation/diffusion-live.html).Lors de la session inaugurale du 28 mars 2012 à 10h, François TADDEI et Garry KASPAROV ont expliqué comment le jeu pouvait aider les éducateurs à innover et faire évoluer leurs méthodes d'enseignements, pour le plus grand bénéfice de leurs élèves. Vu sur Twitter : about Taddei G Gasparov dialog at #eduinov- My dream is to introduce chess in classrooms to help children taking good decisions G. Gasparov- Kids should be happy about learning G Gasparov- Pour G. Kasparov apprentissage doit être amusant, échecs passerelle pour les activités ludiques dans la classe- We have to teach kids how to sort and extract meaning in the huge amount of data of today's world. That's the thing to teach - To combine human creativity and machine brutal force of calcul - G. Kasparov Dimension sociale importante du jeu, TOUS les enfants se retrouvant autour d'un échiquier peuvent réussir. - Echecs = logique, visualisation, calcul, concentration, éthique.- Kasparov : maîtriser ses émotions, être capable d'accepter les conséquences de chaque coup. - G. Kasparov et sa partie contre le reste du monde : travailler de manière collective. Enfants le peuvent aussi : Wikipédia, vikidia- L'intelligence collective peut dépasser l'expert François Taddei - Kasparov a plus de mal contre un collectif de joueurs que contre l'ordinateur d'IBM- L'intelligence collective doit être utilisée, c'est essentiel ! On peut impliquer tôt les enfants - Créer de nouveaux modes collaboratifs pour faire avancer les enfants le plus loin possible François Taddei- Les vilains petits canards peuvent devenir des cygnes encore faut-il le leur permettre F.Taddei - Les enfants sont très créatifs s'ils ont une certaine marge de liberté François Taddei- F. Taddei : le rôle croissant des jeux collaboratifs pour la science (Open science, Foldit, ...)- F Taddei il y a des écoles aux USA où tous les apprentissages se font par le jeu, le jeu permet de prendre des risques - Les échecs sont une activité pionnière pour l'introduction du jeu dans l'enseignement ++- Aujourd'hui nos sociétés sont beaucoup trop prudentes. (...) En réduisant le risque on réduit les retombées positives Kasparov- F Taddei échecs contexte pour apprendre de ses erreurs. Le jeu est un bon moyen pour apprendre de ses erreurs. - La France perçoit l'erreur comme un échec et non comme une prise de risque.- F. Taddei : initiative d'excellence pour que des chercheurs aident des enseignants à innover ++- F. Taddei revient sur le projet IDEFI porté par le PRES SPC: formation des enseignants, pour une meilleure appréhension de l'inno - Taddei : accueillir dans les universités et les labos de recherche les enseignants qui souhaitent innover- Il faut créer des lieux permettant l'interaction mutuelle pour innover - Accueillir dans les universités et les labos de recherche les enseignants qui souhaitent enseigner accueil cri - Education X.0 Wed, 28 Mar 2012 11:38:14 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/actualites/le-projet-idefi-dinstitut-innovant-de-formation-par-la-recherche-selectionne-.html Le projet d'INSTITUT INNOVANT DE FORMATION PAR LA RECHERCHE à Parissélectionné dans le cadre des Initiatives d'excellence en formations innovantes (IDEFI)Un financement de 6,5 Millions d'euros sur 8 ans vient d'être attribué par le Ministère de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche au projet IDEFI porté par François TADDEI pour Sorbonne Paris Cité, en partenariat avec SCIRE Association qui soutient le Centre de Recherches Interdisciplinaires (CRI) de la faculté de médecine de l'Université Paris Descartes. Ce projet a été sélectionné par un jury international avec 36 (sur 93 présentés) autres projets labellisés IDEFI dans le cadre du programme des investissements d'avenir.LE PROJETLe projet a pour objectif d'ouvrir la formation par la recherche au plus grand nombre en formant et en accompagnant les innovateurs de la recherche et de l'enseignement scientifique, afin de développer en France une culture de l'innovation et de rendre accessible à davantage d'acteurs la recherche scientifique en train de se faire.Sorbonne Paris Cité́ et SCIRE Association portent le projet d'Institut Innovant de Formation par la Recherche qui organisera des formations interdisciplinaires innovantes en sciences (formation initiale ou continue, de niveau Master et doctorat) et accompagnera ces innovateurs pour faciliter l'émergence et la réalisation de leurs initiatives.Informations plus détaillées dans le communiqué ci dessous. communiqué́ du 13 mars 2012 et liste des 37 projets retenus (http://www.enseignementsup-recherche.gouv.fr/cid59599/37-projets-de-formation-labellises-idefi.html) Twitter : @FrancoisTaddeiSorbonne Paris Cité sorbonne-paris-cite.fr (http://www.sorbonne-paris-cite.fr)Contact : Anja Schmidt (mailto:anja.schmidt@sorbonne-paris-cite.fr), coordinatrice de la communication, Tél. 01 49 54 83 68, SCIRE Association / CRI : scire.fr (http://www.scire.fr) / cri-paris.org (http://www.cri-paris.org)Contact : Laura Ciriani (mailto:laura@fdv-paris.org), secrétaire générale, Tél 01 44 41 25 21, Sur le même thème voir aussi : Article Le Monde du 3 mars 2012 accueil cri - Actualités Thu, 15 Mar 2012 16:24:08 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/actualites/bubble-t-visualise-les-tweets-sur-les-candidats-a-la-presidentielle.html Samuel Huron, en doctorat à l'Institut de Recherche et d'Innovation du Centre Pompidou et au laboratoire Aviz de l'INRIA, membre fondateur du club Fabelier au CRI, s'est récemment distingué en participant à la création d'un outil permettant de visualiser en temps réel la popularité des candidats à la Présidentielle française 2012 sur Twitter : Bubble T : http://dev.fabelier.org/bubble-t/ (http://dev.fabelier.org/bubble-t/) accueil cri - Actualités Wed, 14 Mar 2012 01:00:00 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/revue-de-presse/sciences-citoyennes-francois-taddei-dans-le-monde-du-3-mars-2012.html Les sciences citoyennes : Les profanes jouent avec les expertsLes technologies du Web et des téléphones portables facilitent la participation du public à des expériences scientifiques et des contre-expertises. L'émergence de ces sciences citoyennes promet de bouleverser la recherche, l'éducation et la société.Lire l'article en entier sur le site du Monde (http://www.lemonde.fr/sciences/article/2012/03/02/les-profanes-jouent-avec-les-experts_1650607_1650684.html)Du même auteur, article sur le blog de David Larrousserie (http://alasource.blogs.nouvelobs.com/archive/2012/03/01/aux-sciences-citoyens.html).   accueil cri - Revue de presse Tue, 06 Mar 2012 01:00:00 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/revue-de-presse/francois-taddei-for-a-science-of-citizen-science--nature-17.02.2012.html NATURE : Citizen science goes 'extreme' Researchers push for wider use of community-generated data in science and policy-making. One solution may be to develop a science of citizen science , suggests Francois Taddei, a molecular geneticist at the Centre for Research and Interdisciplinarity at Paris Descartes University. As the field develops, he says, researchers will need to figure out the optimal division of labour between citizens and professionals. The question is evolving, he says, owing to a slowly developing understanding that expert knowledge does not necessarily trump collective intelligence. read the entire article on Nature website (http://www.nature.com/news/citizen-science-goes-extreme-1.10054) accueil cri - Revue de presse Mon, 20 Feb 2012 01:00:00 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/revue-de-presse/bricoler-le-vivant--un-nouveau-jeu-de-construction-pour-amateurs--afp-28-dec-2011.html Bricoler le vivant: un nouveau jeu de construction pour amateurs ?DEPECHE AFP Sciences et Envisonnementmer, 28/12/2011 - 10:15 La biologie tend-elle à devenir un jeu de Lego avec des briques biologiques ? Les méthodes du do it yourself (DIY), du bidouillage isolé dans un garage, qui ont permis des percées dans l'informatique, s'étendent aussi aussi aux biotechnologies. ( © AFP Eric Piermont)PARIS (AFP) - La biologie tend-elle à devenir un jeu de Lego avec des briques biologiques ? Les méthodes du do it yourself (DIY), du bidouillage isolé dans un garage, qui ont permis des percées dans l'informatique, s'étendent aussi aux biotechnologies.Rêvant de créer un jour leur start-up ou simplement désireux d'expérimenter, de jeunes bricoleurs du vivant manipulent de l'ADN, l'insèrent dans des bactéries pour faire du yaourt fluo ou des biocapteurs détectant la présence de polluants.Après avoir mis au point des boîtes à outils facilitant l'ingénierie du vivant, ces biohackers échangent ces kits de reprogrammation génétique sur internet.Il y a des avancées technologiques telles en biologie synthétique que dès que les gens pensent pouvoir bricoler dans leur propre garage, ils arrivent à trouver des technologies DIY pour le faire , explique Ariel Lindner, co-fondateur du Centre de recherches interdisciplinaires (CRI) à Paris.Transformer des bactéries en usines productrices de biocarburants, de médicaments ou de nouveaux matériaux est un des objectifs de la biologie de synthèse.La communauté DIYbio (http://diybio.org) qui réunit au moins une vingtaine de groupes locaux dans le monde, dont un en France depuis cette année, veut rendre l'expérimentation biologique accessible aux amateurs en dehors des installations professionnelles traditionnelles. Afin de créer librement leurs propres projets. Au CRI, tout est fait dans le cadre d'un laboratoire , souligne M. Lindner, qui depuis 2007 encadre un petit groupe d'étudiants passant leurs vacances d'été à préparer un concours lancé en 2004 par le prestigieux MIT américain. Une compétition invitant à manipuler des briques biologiques standardisées ( Biobricks ) afin de créer des bactéries dotées de nouvelles fonctions : détecter l'arsenic, changer de couleur, d'odeur...Faire compter des bactéries 165 équipes du monde entier, dont quatre venues de Paris, Lyon, Grenoble et Strasbourg, ont participé en 2011 au concours iGEM (international Genetically Engineered Machine) ouvert aux étudiants n'ayant pas encore entamé une thèse.Cette année, l'équipe parisienne comptait une quinzaine de passionnés de différentes disciplines, de la biologie à l'informatique. La culture de la maison, c'est de promouvoir leurs idées et leurs projets , déclare M. Lindner qui cherche à faire de l'enseignement par la recherche .En 2010, les huit membres de l'équipe CRI-Fondation Bettencourt avaient montré qu'on pouvait faire compter des bactéries jusqu'à cinq. Un jeu ? Peut-être une technique utile dans le futur, selon M. Lindner.Si les bactéries issues de l'ingéniérie génétique savaient compter les étapes d'une tâche à accomplir, elles pourraient s'autodétruire quand elles ont fini.Ex-participant à iGEM 2007, Thomas Landrain a créé en avril La Paillasse, premier groupe français réunissant quelques dizaines de passionnés de biologie qui entendent s'inspirer du mouvement DIYbio.org . On a voulu mettre en place un laboratoire qui puisse être accessible à n'importe qui , dit-il, précisant qu'on peut y élever des bactéries. Mais tous les organismes qu'on manipule sont absolument inoffensifs pour l'homme , assure le fondateur de La Paillasse qui poursuit : il y a autant de danger à travailler dans sa propre cuisine que dans notre labo . On ne produit pas d'organismes génétiquement modifiés bien qu'on en ait les moyens , car on ne veut pas être hors la loi, on n'est pas des pirates , ajoute le jeune chercheur qui prépare une thèse de biologie synthétique dans un laboratoire du Génopole d'Evry.© 2011 AFP Par Annie HAUTEFEUILLE Communiqué AFP repris notamment dans :- Les Echos (http://www.lesechos.fr/entreprises-secteurs/infos-generales/science-environnement/afp_00412244-bricoler-le-vivant-un-nouveau-jeu-de-construction-pour-amateurs-268584.php)- Libération (http://www.liberation.fr/depeches/01012380161-bricoler-le-vivant-un-nouveau-jeu-de-construction-pour-amateurs)- 20 Minutes (http://www.20minutes.fr/sciences/849139-bricoler-vivant-nouveau-jeu-construction-amateurs)- Futura Sciences (http://www.futura-sciences.com/fr/news/t/biologie-3/d/de-plus-en-plus-damateurs-samusent-a-bricoler-le-vivant_35649/)- Canoë (http://fr.canoe.ca/infos/sciences/archives/2011/12/20111229-123924.html)- Nord Eclair (http://www.nordeclair.fr/France-Monde/Breves/2011/12/28/bricoler-le-vivant-un-nouveau-jeu-de-con.shtml)- La Montagne (http://www.lamontagne.fr/2011/12/28/bricoler-le-vivant-un-nouveau-jeu-de-construction-pour-amateurs-140581.html)- L'Alsace (http://www.lalsace.fr/actualite/2011/12/28/bricoler-le-vivant-un-nouveau-jeu-de-construction-pour-amateurs)- Voila (http://actu.voila.fr/actualites/sciences/2011/12/28/bricoler-le-vivant-un-nouveau-jeu-de-construction-pour-amateurs_1582377.html)- Orange (http://actu.orange.fr/revue/actualite-culturelle/bricoler-le-vivant-un-nouveau-jeu-de-construction-pour-amateurs-78031/)- France Antilles (http://www.martinique.franceantilles.fr/actualite/france/bricoler-le-vivant-un-nouveau-jeu-de-construction-pour-amateurs-28-12-2011-138540.php) accueil cri - Revue de presse Mon, 16 Jan 2012 01:00:00 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-doctorants/soutenances-de-these/philippe-bun-phd-24.02.2012.html Congratulations to our new FdV Doctor Philippe BUN who graduated on February 24th 2012 at the Institut Jacques Monod.Thesis title : Symmetry breaking and Cell polarization imposed by an external mechanical cue Abstract:Cell polarity establishment implies a symmetry-breaking event, resulting in an axis along which the cell reorganizes. Studies on morphogenesis and cytokinesis reveal the implication of the cortical actomyosin contractility in cell shape changes. Whether the initial event that triggers polarity arises spontaneously or requires an external cue remains controversial. Here we show that single and weak integrin-mediated mechanical cue applied on detached round fibroblasts is required to control the location and duration of symmetry breaking of cortical actomyosin gel instability. Furthermore, we demonstrate that cells respond at a macroscopic level since the induced asymmetric actomyosin flow triggers the 3D migratory polarization axis and determines its orientation. As an initial event, the microtubule-independent actomyosin flow polarizes towards the opposite pole of the cue and drives higher contractility at the rear of the cell that persists after the application of mechanical stress has been halted. Microtubules are further required for long-term growth of leading edge protrusion associated with the MTOC reorientation relative to the cue. These findings support a model whereby the stochastic and transient symmetry breaking events occurring in detached oscillating cells are not able to drive cell polarity establishment, the mechanical stress being required to trigger processes of global auto organization required for long-term functional polarization. The symmetry breaking bias mechanism revealed here in single cells likely emerges as a relevant mechanism for other key processes occurring in tissue morphogenesis. Thesis supervisor: Maïté COPPEY-MOISAN (DIRECTEUR DE RECHERCHE) accueil doctorants - Soutenances de thèse Mon, 27 Feb 2012 15:54:15 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/evenements/amelia-andersdotter--fabelier-cri-17.02.2012-at-1700.html This Friday, February 17th, the CRI club Fabelier will welcome Amelia Andersdotter (http://www.ameliatillbryssel.se/english), European deputy for the Swedish Pirate Party, at 5pm.LIVE STREAMING : http://www.ustream.tv/channel/fabelierRECORDED LIVE : http://www.ustream.tv/recorded/20507055Amelia will talk about contemporary information policy, internet freedom and will explore with us the existing and future bridges between hackerspaces, fablabs, universities, entrepreneurship, open science, and more. Above all we wish a free interaction with the audience and a question-based event, so bring your projects and ideas with you ! Date : 17/02/2012 at 17:00Location :Amphithéatre Lutton (groundfloor)Fac de Médecine24 rue du Faubourg Saint Jacques75014 PARISAn event organized by Fabelier (http://fabelier.org/amelia-andersdotter-fabelier/), already announced by OWNI (http://owni.fr/revue-du-web/rencontre-avec-une-deputee-du-parti-pirate/) and La Cantine (http://lacantine.org/blog/amelia-andersdotter-pirate-party-ue-deputy).Wikipedia : Amelia Andersdooter (born 30 August 1987, Enköping) is a Swedish politician and Member of the European Parliament (MEP), elected on the Pirate Party list in the 2009 election. She became inaugurated in December 2011, being the youngest member of the current parliament.Her blog : http://stenskott.wordpress.com/Follow her Twitter : http://twitter.com/teirdes accueil cri - Evénements Mon, 13 Feb 2012 18:05:27 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/evenements/mitch-altman-at-fabelier-cri-7-feb-2012.html Mitch Altman at Fabelier CRI Paris : Arduino / TV-B Gone workshopMitch Altman (http://en.wikipedia.org/wiki/Mitch_Altman) came to visit Fabelier on Feb. 7th 2012 for an Arduino for Total Newbies 3 hours workshop, from 7pm to 10pm. This workshop taught the participants how to build their own Arduino and how to use it to build a TV-B-Gone (http://www.tvbgone.com/cfe_tvbg_main.php) (Mitch Altman photos) accueil cri - Evénements Mon, 06 Feb 2012 18:05:52 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/evenements/chris-dibona-google-at-the-cri-25.01.2012--at-1900.html Chris DiBona (http://en.wikipedia.org/wiki/Chris_DiBona), the open source guru at Google, will be our Fabelier guest at the CRI Paris tonight at 19:00 for the Web Semantic Workshop. He will take some time to speak about his work at Google, Open-Source and his various projects. You are all welcome to join !http://fabelier.org/chris-dibona-at-fabelier/ accueil cri - Evénements Wed, 25 Jan 2012 17:51:40 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/evenements/2-docteurs-fdv-distingues-par-la-fondation-bettencourt-schueller.html Prix FBS pour les Jeunes Chercheurs, décembre 2011 Chaque année, quatorze prix, d'un montant de 25 000 euros chacun, sont attribués à de jeunes docteurs en sciences afin de leur permettre d'effectuer leur stage post-doctoral dans les meilleurs laboratoires étrangers.Ce prix, crée en 1990, constitue une des premières initiatives de la Fondation.Il a déjà permis de financer le stage post-doctoral de plus de 200 jeunes chercheurs.Cette année, deux Docteurs Frontières du Vivant de la promotion 2007, Jeremie Barral et David Bikard font partie des lauréats 2011 de ce Prix pour les Jeunes Chercheurs. Un grand bravo à tous ces jeunes chercheurs à qui l'on souhaite les plus grands succès dans leur carrière scientifique ! accueil cri - Evénements Tue, 24 Jan 2012 17:25:08 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/evenements/esteban-romeros-visiting-guest-at-the-cri--sept-dec-2011.html The CRI had the pleasure to host Esteban Romero (http://estebanromero.com/about-me/), professor at the Department of Finance and Accounting at the University of Granada (Spain) during his 3 months visit (September 15th - December 15th 2011).On his personal website, back in Granada, he reports about the most remarkable activities I carried out at the Centre de Recherches Interdisciplinaires among us with lively testimony, videos and pictures he has produced during his stay.Thank you Esteban for your comments ! accueil cri - Evénements Thu, 19 Jan 2012 22:59:41 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-doctorants/financements/ile-de-france-region-grants-for-phd-and-research-projects-2012.html Allocations de recherche doctorales Région Ile de France Deadline for applying through FDV doctoral school is February 10th 2012 !This call for proposals is to assign some 36 months grants to research projects financed by the Région Ile de France for PhD projects conducted in labs based in Ile de France.Applications must be sent by the doctoral school.All candidates must have a Master 2 degree (or DESS, DEA) and be registered for 2012/2013 in 1st or 2nd year PhD in an ED in Ile de France.Open to all nationalitiesFellows over 30 years of age must produce a document explaining their careerCandidates who already have a PhD are excluded, as well as candidates registered in another ED. Hors DIM (http://www.iledefrance.fr/?id=16109) - Santé, environnement et toxicologie Deadline for applying through FDV doctoral school is February 10th 2012 ! Contact : Céline Garrigues (mailto:celine@fdv-paris.org) - Tél. 01 44 41 25 22   accueil doctorants - Financements Tue, 24 Jan 2012 11:56:12 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-doctorants/financements/axa-doctoral-fellowships-2012--advanced-deadline-january-19th-2012.html Deadline to submit the application to the doctoral school : JANUARY 19th 2012The applications for AXA Research Fund 2012 (recruitment of doctoral students) is now open.PhD Application GuidelinesOnly institutions may apply for these fellowships. No individual student applications will be accepted or reviewed.Please note that each candidate cannot submit the same proposal several times. An applicant can be presented by only one institution. accueil doctorants - Financements Tue, 03 Jan 2012 17:10:15 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/education-x.0/francois-taddei-et-la-nouvelle-science-des-amateurs---internetactu-30.11.2011.html InternetActu.net, 30/11/2011 Article « La nouvelle science des amateurs »par Rémi SussanPublié le 30 novembre 2011 Dans le cadre du séminaire Nouvelles pratiques et cultures du numérique dans les sciences et les technologies du Centre d'Alembert à la Faculté d'Orsay, Francois Taddei chercheur à ̀l'Inserm, directeur du Centre de Recherches Interdisciplinaires et responsable de l'initiative Universités X.0. et Thomas Landrain ont animé la séance du 23 novembre 2011 : Science participative, apprentissage collaboratif : Traitement collaboratif de problèmes et de grandes masses d'information, apprentissage par la recherche en réseau, quelles perspectives et quelles influences sur l'enseignement académique ? (programme de cette séance (http://www.centre-dalembert.u-psud.fr/#S6)). Interview des intervenants François Taddei et Thomas Landrain par InternetACTU à cette occasion : Citations : « Beaucoup s'inquiètent aujourd'hui des mutations de l'enseignement supérieur. Tandis que le nombre d'étudiants augmente, les contenus des cours doivent voir leur qualité s'améliorer dans des limites budgétaires de plus en plus strictes (...) Nous devons être en mesure de développer de nouvelles compétences, savoir coopérer, nous montrer créatifs, critiques, et ce, de manière constructive (...) La nouvelle attitude scientifique, exploratoire, fun, procédant souvent un peu à l'aveuglette, Taddei la nomme la science de nuit , en reprenant une expression du célèbre biologiste François Jacob. Si la science de jour est celle des publications, des cours en amphi, la science de nuit, tâtonnante, ludique, est un domaine auquel peuvent participer l'ensemble des citoyens, y compris les plus jeunes . Lire l'article sur le site InternetACTU (http://www.internetactu.net/2011/11/30/la-nouvelle-science-des-amateurs/) accueil cri - Education X.0 Thu, 01 Dec 2011 12:41:25 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/revue-de-presse/portrait-de-francois-taddei-dans-la-recherche-novembre-2011.html Article LA RECHERCHE : « Le système éducatif devrait s'inspirer de l'évolution des bactéries »par Denis DelbecqPublié dans le Mensuel N°457 - Novembre 2011 - page 80 Portrait d'un biologiste engagé : « Le système éducatif devrait s'inspirer de l'évolution des bactéries »Citations : Inspiré par ses découvertes sur les micro-organismes, le généticien moléculaire François Taddei milite pour une réforme de l'enseignement. Le but : préparer les jeunes générations à affronter les défis d'un monde en mutation.(...) « Avant, le savoir était rangé dans des bibliothèques spécialisées. Internet provoque une mutation dans les échanges entre disciplines. » (...)L'éducation est devenue un combat. « Quand mon fils ainé est entré au cours préparatoire, sa maitresse m'a dit : Il est charmant cet enfant, mais il pose beaucoup de questions. Or c'est en posant des questions qu'on apprend ! C'est grâce à cela qu'on peut initier les jeunes enfants à la recherche, justement parce qu'ils se posent des questions. »Lire l'article en entier sur le site de La Recherche (http://www.larecherche.fr/content/recherche/article?id=30689). (accessible sous réserve d'enregistrement gratuit) accueil cri - Revue de presse Tue, 29 Nov 2011 01:00:00 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/education-x.0/francois-taddeis-interview-for-world-innovation-summit-for-education.html François TADDEI, director of the Center for Research and Interdisciplinarity was a guest speaker and was interviewed for the WISE Learners Voice Channel during the World Innovation Summit for Education that took place in Doha, Qatar November 1 - 3, 2011 and explored the theme of Changing Societies, Changing Education .Watch the interview on Youtube : Dr François Taddei biography (http://www.wise-qatar.org/content/dr-francois-taddei) accueil cri - Education X.0 Mon, 28 Nov 2011 12:14:30 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/evenements/laurent-keller-university-of-lausanne--at-the-cri-10-nov-2011.html The CRI is honoured to welcome Prof. Laurent Keller (University of Lausanne) for a presentation that will take place on November 10th at 18:30 at the CRI.Don't miss this special event !Talk title : Evolution of a social chromosome in ants . Abstract of the talk by Laurent Keller : In this talk I will discuss how interactions between genes and social environment influence behavior and social organization. In particular, I will show that, in ants, worker behavior and gene expression profiles are more strongly influenced by indirect effects associated with the genotypic composition of workers within their colony than by the direct effect of their own genotype. This constitutes an unusual example of an extended phenotype, and suggests a complex genetic architecture directly and indirectly influencing the individual behaviors that, in aggregate, produce an emergent colony-level phenotype. I will finally discuss of these gene by environment interactions underlie the presence of two distinct modes of social organization. Laurent Keller's webpage (http://www.unil.ch/dee/page7717.html) accueil cri - Evénements Wed, 09 Nov 2011 11:43:24 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/evenements/fabelier-special-guest--jeff-clune-cornell-univ.-at-the-cri--9-nov-2011.html The CRI Fabelier club is proud to welcome a Special Guest, Jeff Clune from Creative Machines Lab, Cornell UniversitySome of you many know Jeff's work from his online project http://endlessforms.com/ In this talk, he will tell us about simulating evolution, evolving programs that control robots, as well as crowdsourcing the evolutionary process. Questions and discussion will be encouraged, as always. Time: Wednesday, 9 November, 18:30. Place: Room 2006, Center for Research and Interdisciplinarity, Medicine Faculty Cochin, 24 rue du Fabourg Saint JacquesTalk abstract: I will describe my work with an algorithm that combines evolution with developmental biology to automatically produce complex designs. This algorithm enables the generation of complex, regular phenotypes, such as three-dimensional objects and artificial neural networks to control robots. The evolved morphologies and neural networks exhibit desirable properties found in their natural counterparts, such as symmetries and repeated motifs. I will also describe a project that combines this algorithm with crowdsourcing to allow internet users to collectively explore the evolutionary design space. At EndlessForms.com, visitors individually direct evolutionary processes similar to how breeders evolve roses or dogs. Collectively, visitors have evaluated over 2.4 million objects and have produced an interesting and diverse set of evolved objects. Biography : Jeff Clune is a Postdoctoral Fellow in Hod Lipson's lab at Cornell University, funded by a Postdoctoral Research Fellowship in Biology from the National Science Foundation. He studies generative encodings, which enhance evolutionary algorithms by augmenting them with concepts from developmental biology. These concepts enable the assembly of complex neural networks and other forms from compact genomes. One of Jeff's current projects is EndlessForms.com, a website for designing and printing 3D objects with such encodings. Jeff also develops evolutionary algorithms to investigate open questions in evolutionary biology, and has published work on the evolution of altruism, phenotypic plasticity, and evolvability. Jeff was the co-chair of the Generative and Developmental Systems track at GECCO, the Genetic and Evolutionary Computation Conference (2010-2011). He has a Ph.D. in computer science from Michigan State University, a master's degree in philosophy from Michigan State University, and a bachelor's degree in philosophy from the University of Michigan. Articles about his research have appeared in news publications such as MSNBC.com, The New Scientist, The Daily Telegraph, Slashdot, MIT's Technology Review, and U.S. News World Report.website : http://jeffclune.com/ (http://jeffclune.com/) accueil cri - Evénements Tue, 08 Nov 2011 01:00:00 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-doctorants/soutenances-de-these/mael-montevil-phd-07.10.2011.html Congratulations to our new doctor Mael Montevil who graduated with the very Honourable grade and congratulations of the Jury on October 7th 2011 Thesis title : Biological time and extended critical transitions : towards and objectivization of the living state of matter.Abstract : accueil doctorants - Soutenances de thèse Mon, 24 Oct 2011 12:29:09 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-doctorants/soutenances-de-these/getao-shi-phd-17.10.2011.html Congratulations to our new doctor Getao SHI who graduated with the very remarkable grade on October 17th 2011 Thesis title : Development of functional proteomics approcahes for studying retrograde transportThe thesis defense took place at 9:30am on October 17th 2011 in Amphithéâtre Constant Burg(downstairs of the building) of Curie Institute. Abstract : accueil doctorants - Soutenances de thèse Thu, 20 Oct 2011 19:32:33 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/igem-paris-liliane-bettencourt/premier-succes-pour-lequipe-igem-paris-bettencourt-2011-.html 3/10/2011L'organisation du Concours iGEM a été revue en 2011 pour faire face à l'afflux croissant de candidatures, les équipes devant au préalable se qualifier lors d'épreuves régionales de sélection. Le 2 octobre 2011 à Amsterdam se tenaient les épreuves finales de sélection iGEM pour la Région Europe/Afrique (Regional Jamboree Europe) avec la participation de 50 équipes européennes et la première participation de plusieurs équipes africaines. Le projet de l'équipe iGEM Paris Bettencourt, concernant la caractérisation de nouvelles formes de communication entre bactéries par l'intermédiaire de nanotubes, a été très remarqué et salué par le Jury et l'ensemble des participants de l'évènement.L'équipe s'est particulièrement distinguée en se classant parmi les 3 meilleures équipes, elle a remporté une Médaille d'Or et le Prix de la Meilleure présentation (Best presentation). Elle s'est ainsi qualifiée parmi les 18 équipes européennes invitées à participer à la Finale mondiale (World Championship Jamboree) au Massachussets Institute of Technology (MIT) du 5 au 7 novembre 2011 à Boston, à laquelle participeront également les 18 équipes qualifiées des Amériques et les 18 qualifiées d'Asie issues des sélections régionales (Regional Jamboree) se tenant les 10 et 16 octobre prochains.Web : iGEM Paris Bettencourt (http://2011.igem.org/Team:Paris_Bettencourt) accueil cri - iGEM Paris Liliane Bettencourt Wed, 05 Oct 2011 01:00:00 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-doctorants/soutenances-de-these/kevin-ho-wan-phd-30.09.2011.html Congratulations to our new doctor Kevin Ho Wan with the very Honourable grade and congratulations of the Jury on September 30th 2011 Thesis title : Single-Molecule Studies of the Bacterial Transcription Coupled Repair ProcessAbstract : Transcription coupled repair (TCR), a sub-pathway of the nucleotide excision repair mechanism, is activated when a RNA polymerase (RNAP) is arrested during transcription by DNA damage. TCR is a ubiquitous cellular response important for maintenance of DNA integrity. Some human genetic disorders are associated with defect on TCR, like the Cockayne syndrome for instance. In the bacterium Escherichia coli, TRCF, the product of the mfd gene, is the DNA translocase that couples transcription and DNA repair: it recognizes a stalled ternary elongation complex, dissociates it, and recruits the UvrABC repair machinery.We used a single molecule approach, by means of magnetic tweezers, to study the initiation of TCR and monitored the dissociation of individual RNAPs by individual TRCFs in real time. We have identified that TRCF acts on stalled RNAP by remodeling the transcription bubble in two successive ATP-dependent steps separated by a novel intermediate denoted RD*. Statistical analysis of the time required to dissociate the stalled RNAP at different concentrations of TRCF has shown that the displacement of the ternary elongation complex is a three limiting-steps process: (i) recruitment of TRCF to the stalled RNAP, (ii) activation of TRCF and initiation of the dissociation of RNAP by rewinding of 2/3 of the transcription bubble , and (iii) complete dissociation of the elongation complex. The intermediate complex RD* formed after the first step of rewinding is characterized by a long lifetime, which suggests that it would behave as a temporally reliable marker, enabling the recruitment of the UvrABC repair machinery to the damaged site. accueil doctorants - Soutenances de thèse Wed, 05 Oct 2011 14:00:27 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/evenements/fdv-aiv-cri-opening-days-10-11-october-2011.html CRI Opening Days, September 2010.The new year opening seminar will take place on Monday 10th and Tuesday 11th of October 2011, in the amphithéâtre Jean-Pierre LUTON on the groundfloor (RDC) of the Faculty of Medicine COCHIN, 24 rue du faubourg St Jacques, Paris 14. This seminar is mandatory for all FdV and AIV students. It will be the occasion to get to know each other, share our scientific interests and build together much of the year's program, in particular to organize and initiate the year's CRI clubs (workshops) as well as the AIV / FdV program of courses and seminars of the year.These activities open for all our students will be also the occasion to carry out administrative steps that might still be necessary for them. This year, in addition to the AIV master and FdV PhD programs the CRI is happy and proud to welcome in our community the new undergraduate program Licence Frontières du Vivant ! As you well know, during this meeting, we will work to establish the year's content and activities, focusing on how to enrich the links between the different programs for the benefit of all. Current AIV and FdV students are presenting themselves through a poster.Don't miss this special event and our two Guest talks : - Michel MORANGE (Ecole Normale Supérieure, IHPST) on Monday 10th at 9:15 AM (amphi LUTON) - Alan JOHNSTON, CoMPLEX (Centre for Mathematics and Physics in the Life Sciences and Experimental Biology), University College London, on Monday 10th at 18:00 (amphi LUTON) Download the Opening Days program. accueil cri - Evénements Wed, 05 Oct 2011 14:43:55 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-doctorants/soutenances-de-these/kathleen-zylbersztejn-phd-15.09.11.html Congratulations to our new doctor Kathleen Zylbersztejn who graduated with the very Honourablme grade and congratulations of the Jury on September 15th 2011 Kathleen Zylbersztejn (left) with PhD colleagues Lydia, Maja, Imène and Francesca (FdV). Thesis title : role of vesicular traffic in axon guidance Abstract : accueil doctorants - Soutenances de thèse Thu, 22 Sep 2011 12:14:48 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-doctorants/soutenances-de-these/ruben-elisee-phd-09.09.2011.html Congratulations to our new doctor Ruben Elisée who graduated with congratulations of the Jury !His thesis defense took place on September 9th 2011 in the Pasteur Institute in Paris.Thesis title Analysis of mitochondrial metabolism in response to peptidoglycan in epithelial cell (in french) : La réponse métabolique de cellules épithéliales au peptidoglycane Noah Hardy, FdV teacher, had the chance to attend Ruben Elisée's thesis defense and wrote us a report of this Event : accueil doctorants - Soutenances de thèse Thu, 15 Sep 2011 12:39:25 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/evenements/fdv-aiv-cirp-workshop-in-sevres-4-9-sept-2011.html new! Photo gallery - Friday 9.9.2011CREATING INTERDISCIPLINARY RESEARCH PROJECT WORKSHOPSEVRES, 4-9 September 2011 The workshop, set in Sèvres (near Paris), intends to assemble free spirited students and researchers from broad scientific backgrounds to conceive creative projects at the interface with Life Sciences. This year will combine newcomer students of the FdV PhD program, 2nd year AIV master program and will host students of the new Licence FdV program on Friday. The CIRP workshop attempts to provide the primary basis for collegiality and communication through dialogue and brainstorming on open questions in Life Sciences.Aims of the workshop : accueil cri - Evénements Mon, 29 Aug 2011 01:00:00 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/revue-de-presse/creatingbridges.org--sharing-my-conversation-with-francois-taddei.html Lire le billet (http://creatingbridges.org/sharing-my-conversation-with-francois-taddei/) sur le blog creatingbridges.org accueil cri - Revue de presse Tue, 23 Aug 2011 17:36:21 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/evenements/wokshop-hands-on-experiments-scientific-discovery-games.-at-the-cri.html Workshop: Hands-on Experiments, Scientific Discovery Games and Citizen ScienceLearning through Research for all Paris, July 10-13, 2011 Organizers: François Taddei, Ariel Lindner Livio Riboli-Sasco Aims of the workshop Learning by practising true scientific research provides invaluable experience as one gets not only the classical scientific knowledge that is produced by what François Jacob called day science , but also the thrill of night science that only the exploration of the unknown can provide. Unfortunately, too few people have access to such experiences as research is mostly conducted in the few places that have the resources and trained faculties. Interestingly, different initiatives that focus on promoting hands-on experiments that are cheap and easy to realize and to citizen science , crowd sourcing of research and scientific discovery games . These changes to educational practices make night science accessible to any internet users and allows even the youngest children to contribute to scientific research. This workshop aims at bringing those who innovate along these lines, together with motivated students and innovative faculty members. We will look for synergies between the different scientific areas covered by the projects that have been proposed, as well as in between online and real life activities as both can promote learning through research. Finally, we will discuss possibilities to attract larger audiences and look for ways of stimulating the development of such approaches on larger scales across the globe. Speakers by order of talk Zoran Popovic (University of Washington)Harry Swinney (University of Texas)François Taddei (CRI, Inserm, Paris Descartes University)Eva-Maria Schoetz (HoS, Princeton University)Mark Shattuck (HoS, City University of New York)Michael Schatz (HoS, Georgia Tech)Kenneth Showalter (HoS, West Virginia University)Ingmar Riedel-Kruse (Stanford University)Scott Barolo (University of Michigan)Robert Full (University of California Berkeley)Jeehyung Lee (Carnegie Mellon)Joseph Niemela (Trieste, International Centre for Theoretical Physics ICTP)Onofrio Gigliotta (ISTC Roma and University of Naples Federico II)Thomas Schaus (Harvard)Thomas Murphy (University of Mariland)Kenneth Stanley (University of Central Florida)Eva Guinan (Harvard)François Grey (CERN, Citizen Cyberscience Center, Geneva)Beau Lotto (University College London)Program Participants (docs/Workshop%20Program10-13%20July%202011.pdf) accueil cri - Evénements Fri, 08 Jul 2011 01:00:00 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/la-recherche-au-cri/cri-research-in-science-mag-24/06/2011.html In an Frontiers of Life Sciences ( Frontières du Vivant ) Liliane Bettencout PhD program. (http://www.fdv-paris.org) (ED 474, dir François Taddei) The ability to spatially control localization of enzymes within cells is of big interest for synthetic biology - the science that deals with engineering microorganisms to produce interesting compounds for humans. Clustering into micro-compartiments or onto scaffolds helps direct substrate flow in-between interacting proteins, limits cross-talk between signaling pathways, and generally increases specificity and yields of sequential metabolic reactions. To achieve de novo modular control over spatial organization, the researchers borrowed and applied to biology a number of principles from DNA nanotech field. Bacteria were engineered to produce non-coding RNA designed to assemble and polymerize into large structures within cells. These structures were then used as docking sites for proteins involved in a synthetic bio-hydrogen pathway. A high increase in yield was observed as a function of scaffold geometries. Interestingly, this is also a totally modular system potentially applicable to other pathways. This invention takes us one step closer to the idea of synthetic organelles and to the possibility of engineering microorganisms to help us reach sustainable goals. This new level of control in synthetic biology also opens the door to studying more fundamental research questions and new applications in medicine.Contact : Camille Delebecque / Ariel Lindner (mailto:contact@fdv-paris.org) accueil cri - La recherche au CRI Fri, 24 Jun 2011 09:36:10 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-doctorants/soutenances-de-these/thomas-julou-phd-09.06.2011.html Congratulations to our new doctor Thomas Julou who graduated on June 9th 2011 !Her thesis defense took place at the Ecole Normale Supérieure Physics Departement in Paris.Thesis title« Evolution, competition and cooperation in bacterial populations »Members of the JuryDidier Chatenay (CNRS 3231, Paris), PresidentIvan Matic (Inserm U1001, Paris)Sam Brown (University of Edinburgh, UK) Pierre Cornelis (Vrije Universiteit Brussels)David Bensimon (CNRS, ENS Paris), Supervisor Nicolas Desprat (Université Paris Diderot)Abstract The interplay of environment, heritability, and stochasticity results in the development of different individuals starting from a given genotype. This phenotypic variability affects how natural selection acts on genetic variability. From a general perspective, I aim at studying the impact of phenotypic variability on adaptive dynamics.In the first chapter, I report on the design of an evolutionary experiment in a structured environment using Escherichia coli. The trait under selection is resistance to high temperature. In particular, we study the effects of high temperature on chemotaxis, as well as the impact of acclimation on growth and survival at high temperature.The second chapter is about the development of a microbial population measurement device dedicated to diluted populations. This continuous, non-invasive measurement has a low detection limit that depends on the species. For the model species Escherichia ecoli, the limit is ca. 5000/mL which represents a 100-fold improvement compared to classical photometric methods.In the third chapter, we study the distribution of pyoverdine between individuals of a clonal population of Pseudomonas aeruginosa. The variability of the concentration of this siderophore is much greater than expected. Although pyoverdine is considered to be a public good, neither spatial heterogeneity nor heritability provide a meaningful description of the variability. Instead we characterize rapid fluctuations in pyoverdine concentration, and propose a model based on a phenotypic switch in pyoverdine metabolism that is in good agreement with the experimental data. accueil doctorants - Soutenances de thèse Wed, 15 Jun 2011 01:00:00 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/revue-de-presse/francois-taddei-dans-la-croix--des-qu’on-change-de-regard-de-point-de-vue-on-s’enrichit..html LA CROIX 3/6/2011 Enquête « Apprendre Autrement » mai/juin 2011- 4e semaine « Apprendre avec plaisir ? » Article L'appétit de connaissance n'a pas d'âge par Cécile Jaurès Publié le 3 juin 2011 Citations : « Dès qu'on change de regard, de point de vue, on s'enrichit. La curiosité intellectuelle est un état d'esprit et une pratique quotidienne », insiste François Taddéi, biologiste et directeur d'une unité de recherche à l'Inserm (...) En France, les disciplines sont bien trop cloisonnées. Il est difficile de faire quelques heures en dehors de sa matière dominante. Dans les meilleures universités américaines, c'est le contraire. Steve Jobs, patron d'Apple, a dit un jour que la chose la plus importante qu'il a apprise à l'université, c'était la calligraphie. Et il a appris l'informatique tout seul ! . Lire l'article (http://www.la-croix.com/Actualite/S-informer/France/L-appetit-de-connaissance-n-a-pas-d-age-_NP_-2011-06-03-621525) sur le site du quotiden La Croix. accueil cri - Revue de presse Fri, 17 Jun 2011 17:21:16 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/evenements/ashoka-changemakers-week--debat-education-au-cri-17/06-at-1600.html Débat A quoi ressemblera l'éducation de demain? avec François Taddei au CRI dans le cadre de la thématique Les jeunes changent le monde de Changemakers' City Paris.Date : le vendredi 17 juin 2011 de 16h à 19h.Lieu : Centre de Recherches InterdisciplinairesAdresse : Faculté de Médecine, site Cochin Port-Royal Université Paris Descartes 24, rue du Faubourg Saint Jacques 75014 ParisRER B Port Royal / M° St Jacques Découvrez le Centre de Recherches Interdisciplinaires et sa pédagogie innovatrice. Participez à une discussion sur la possibilité pour les étudiants de devenir leaders actifs et autonomes de leur éducation, du bac à la thèse. Explorez leur potentiel de contribution à la recherche à travers le crowdsourcing et des jeux de découverte scientifique. François Taddei présentera à cette occasion le projet du CRI de création d'un incubateur pour des projets éducatifs à Paris.Cet événement fait partie de l'ASHOKA CHANGEMAKERS' WEEK (http://ashoka-changemakersweek.com) qui accueille du 16 au 23 juin 2011 à Paris les entrepreneurs sociaux du monde entier.François TADDEI interviendra également au cours de deux sessions du cycle Devenir Acteur de changement de l'Ashoka Changemakers' Campus :- Mercredi 22 juin 2011 - 11:00 - 12:30 : Repensons nos modèles ! (http://ashoka-changemakersweek.com/?id_page=campusacteur) pour la session Changeons de regard sur l'éducation (session en anglais)- Mercredi 22 juin 2011 - 14:30 - 16:15 : Construisons ensemble les solutions de demain ! (http://ashoka-changemakersweek.com/?id_page=campusacteur) pour la session Universités X.0 *François Taddei est directeur de recherche à l'Inserm (biologie des systèmes), spécialiste reconnu de l'évolution et militant des approches interdisciplinaires. Il participe également à différents groupes de travail sur l'avenir de la recherche et de l'éducation (« France 2025 », rapport OCDE...) accueil cri - Evénements Thu, 16 Jun 2011 10:36:26 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/evenements/fdv-workshop-on-neuro-and-cognitive-sciences-25-may-2011-at-the-cri.html From single neurons to complex pathways: a multi-scale approach of cognition with Spécial Guest Stella de Bode (Univ California) FDV Workshop on Neuro and Cognitive Sciences WednesdayMay 25th at the CRI 9h30 - 18h00Curious about neurosciences or cognitive sciences ? Don't hesitate to join us for this day of workshop around a multi-scale approach of cognition from single neurons manipulation to complex networks modelization ! We will discuss very diverse topics from the role of the cannabinoid receptor to modelization of language learning. You will discover how we can build complex neuronal networks in vitro or in silico, what is the critic role of astrocytes in our brain and many other things. Moreover we have the pleasure and honour to welcome Stella de Bode from University of California, Los Angeles who will talk about Post Cerebral Hemispherectomy: From Equipotentiality to Irreversible Lateralization of Language . You may read the program of the day below and download the detailed program of the day with the abstract of the different presentations. (docs/FDV_Workshop_Neuro_Detailed_Program.pdf) Looking forward discussing with many of you tomorrow ! WORKSHOP PROGRAM 9h30-10h15: Anne-Lise Gaffuri Drosophila melanogaster: a model system to study neuronal GPCRs? Laboratoire de Neurobiologie, CNRS-UMR 7637, ESPCI-ParisTech. Zsolt Lenke10h15-11h00: Delphine Ladarré : Live imaging of type-1 cannabinoid receptor signaling at single neuron scale Laboratoire de Neurobiologie, CNRS-UMR 7637, ESPCI-ParisTech. Zsolt Lenkecoffee break11h15-12h00: Romain Cazé LNC INSERM 960, Boris GutkinIntrinsic plasticity in non-linear dendrites gates pyramidal computation.12h00-12h45: Jéréie Sibille Astrocyte just a supportive cell for neurons or a new scale for neuronal integration? Rouach Nathalie (Collège de France) Holcman David (ENS)lunch break13h45-14h30: Maéva Vignes In vitro reconstruction of neuronal networks and applications to study neurodegenerative diseases. Curie's Institute - Jean-Louis Viovy and Bernard Brugg14h30-15h15: Alexandre Grémiaux Neural encoding of sex-pheromone in moth olfactory brain: from data analysis to modelling INRA, Jean-Pierre Rospars and INRIA Dominique Martinezcoffee break15h30-16h15: Mélanie Strauss States of consciousness in sleep. 16h15-17h15: SPECIAL GUEST Stella de Bode (http://www.google.com/url?sa=t source=web cd=1 ved=0CBsQFjAA url=http%3A%2F%2Fwww.sph.sc.edu%2FDocuments%2FCV_deBode.pdf) (University of California, Los Angeles) Post Cerebral Hemispherectomy: From Equipotentiality to Irreversible Lateralization of Language. 17h15-18h00: Luc Boruta : Learning phonemes in parallel universes. ALPAGE (Univ. Paris 7 INRIA), LSCP (EHESS, ENS CNRS)   accueil cri - Evénements Tue, 24 May 2011 16:17:12 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/evenements/evening-with...-faisal-aldaye-harvard-at-the-cri-06/05/2011.html The CRI has the pleasure to invite you to an Evening with... Faisal Aldaye (Harvard) on Friday, May 6th at 17:30Location :in Seminar Room 2006 - 2nd FloorCentre de Recherches InterdisciplinairesFaculté de Médecine Paris Descartes24 rue du Faubourg Saint Jacques - 75014 Paris Some background on our guest:In 2008, Faisal Aldaye became a research fellow with Professor Pamela Silver (http://silver.med.harvard.edu/) at the Department of Systems Biology at Harvard Medical School, where he is applying the principles of DNA nanotechnology to solve problems in a practical way. He is also a member of the Wyss Institute for Biologically Inspired Engineering (http://wyss.harvard.edu) at Harvard University. He received his B.Sc. in Chemistry and his Ph.D. in DNA nanotechnology from McGill University. His achievements have been recognized with numerous awards, including the IUPAC Prize for Young Chemists (http://www.iupac.org/web/nt/2009-04-02_2009_winners) and the Governor General's Gold Medal. He currently holds an NSERC Doctoral award (http://www.nserc-crsng.gc.ca/Prizes-Prix/Doctoral-Doctorat/Profiles-Profils/FaisalAldaye_eng.asp), given to researchers who have demonstrated superior competence and outstanding productivity. List of Faisal Aldaye publications (http://connects.catalyst.harvard.edu/profiles/profile/person/48281) The session will be followed by a buffet with wine, cheese etc and open discussion. accueil cri - Evénements Wed, 04 May 2011 17:52:47 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-doctorants/soutenances-de-these/helene-dupont-phd--29-04-2011.html Congratulations to our new doctor Hélène Duponti's who graduated with congratulations of the Jury !Her thesis defense took place on April 29th 2011 in the Institut de Paléontologie Humaine.Thesis title (in french) « Modélisation multi-agents d'un service écosystémique, scénarios de systèmes d'équarrissage par des rapaces nécrophages »Members of the JuryAbbadie Luc, Professeur à l'université Paris VI et directeur du laboratoire BIOEMCO, ExaminateurBergandi Donato, Maître de conférences au MNHN, RapporteurBobbé Sophie, Chercheure associée au Centre Edgar Morin CNRS/EHESS, Co-Directrice de thèseFritz Hervé, Directeur de recherche CNRS, RapporteurLarrère Raphaël, Directeur de recherche INRA, ExaminateurLe Page Christophe, Cadre de recherche CIRAD, ExaminateurMathevet Raphaël, Chargé de recherche CNRS, ExaminateurSarrazin François, Professeur Université Paris VI, Directeur de thèseAbstract (in french) La conservation des vautours dépend en partie de la gestion de leurs ressources trophiques, qui, en Europe, est largement liée aux activités pastorales et contrainte par les réglementations sanitaires. Cependant, par leur régime alimentaire charognard, les vautours rendent des services écosystémiques. Ainsi, la mise à disposition de carcasses à ces rapaces nécrophages peut être envisagée comme favorable, puisqu'elle permet de préserver des espèces emblématiques et de maintenir les services qu'elles offrent. En s'appuyant sur des entretiens ethnologiques et des données écologiques, cette étude sur l'équarrissage naturel dans le contexte agropastoral qui est le sien, a été menée selon une approche interdisciplinaire. Suivant les préconisations issues du Millenium Ecosystem Assessment (M.E.A.), un modèle a été développé en vue d'explorer les « réactions » de ce service à des pratiques humaines. Dans notre cas, il s'agissait d'évaluer les conséquences de modes de gestion locale de l'équarrissage sur une population de vautours et sur des bénéfices environnementaux et économiques qu'elle génère. Au moyen de la modélisation multi-agents, un modèle à caractère générique a été développé. Il représente explicitement les comportements d'alimentation d'une population de vautours fauves - constituant « l'offre » de service -, et la mise à disposition des carcasses aux vautours- représentant la « demande » pour le service. L'offre fluctue selon la dynamique de population de vautours. La demande varie selon les pratiques agropastorales qui influencent la mortalité des troupeaux, et les choix de pratiques d'équarrissage des éleveurs. Les résultats montrent que les conséquences environnementales et économiques de l'équarrissage dépendent avant tout des dispositifs d'équarrissage mis en place sur un même site, sachant que l'équarrissage naturel peut prendre plusieurs formes. A ce propos, les résultats soulignent les avantages de l'utilisation d'un dispositif d'équarrissage naturel géré directement par chaque éleveur, la placette. Néanmoins, les bénéfices offerts par une population de vautours, comme la pérennité de celle-ci, dépende de l'utilisation ce dispositif. Or, les manières d'envisager le recours à l'équarrissage naturel relèvent avant tout de représentations sociales variées des éleveurs et de leurs relations aux autres acteurs de l'équarrissage. Le recours à l'équarrissage naturel ne correspond pas toujours aux capacités d'élimination des carcasses des vautours. Lorsque la demande et l'offre sont en décalage, des conséquences négatives pour les humains comme les vautours peuvent survenir. L'ajustement de la mise à disposition des carcasses aux besoins alimentaires des vautours est de première importance pour assurer une gestion à long terme de l'équarrissage en y intégrant les vautours. Enfin, l'adaptation du modèle à une situation existante révèle l'importance de resituer l'étude dans un contexte particulier en vue de recommander des mesures de gestion. Les approches interdisciplinaires offrent la possibilité d'une certaine réflexivité sur le processus de recherche. A partir des rapports à la modélisation des chercheurs en sciences sociales et des écologues, l'intégration des dimensions sociales dans la modélisation de systèmes socio-écologiques est discutée. Nous soulignons les avantages de la participation de chercheurs en sciences sociales dans les approches de modélisation pour la conservation. Enfin, les implications théoriques, actuelles et potentielles d'envisager les rapaces nécrophages comme des producteurs de service en vue de leur conservation, sont explorées. Elles sont replacées dans une perspective plus large, pour reconsidérer la pertinence du concept de service écosystémique -tel que mobilisé par le M.E.A.- pour la conservation de la nature. Keywords (in french) : équarrissage ; Vautour fauve ; service écosystémique ; interdisciplinarité ; système socio-écologique ; modélisation multi-agents ; conservation des espèces. accueil doctorants - Soutenances de thèse Tue, 03 May 2011 17:01:02 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-doctorants/soutenances-de-these/marianne-mugabo-phd-11.04.2011.html Congratulations to our new doctor Marianne Mugabo that graduated with the very honourable grade !Her thesis defense took place on April 11th 2011 in the Ecole Normale Supérieure in Paris. Thesis title (in french)Structure de population et histoire de vie chez le lézard vivipare Thesis co-supervisors : Jean-François Le Galliard and Régis Ferrière. Members of the JuryJean-Michel Gaillard (rapporteur)Christophe Barbraud (rapporteur)Tim Benton (examinateur)Anne Charmantier (examinatrice)François Sarrazin (examinateur)Michel Morange (examinateur)Abstract (in french)La structure des populations influence de manière importante le taux de croissance des populations et donc leurs capacités à faire face à des changements environnementaux. En effet, elle détermine la part d'individus qui contribuent au renouvellement des générations ainsi que l'intensité des interactions sociales compétitives et coopératives. Utilisant le lézard vivipare (Zootoca vivipara, Jacquin 1787) comme modèle d'étude, mon travail de thèse consiste à caractériser la relation entre la structure de population (en termes de cohortes, densité et classes d'âge et de sexe), l'histoire de vie et la dynamique de petites populations isolées. Pour cela, nous combinons des approches expérimentales en conditions semi-naturelles à des approches théoriques utilisant des modèles populationnels à un et deux sexes structurés en classes d'âge. Une analyse critique de la littérature montre que la variabilité environnementale peut générer des différences d'histoire de vie entre cohortes de naissance, ou effets cohortes, à travers son influence sur la qualité des individus et sur l'intensité de la compétition intraspécifique au sein d'une cohorte et entre cohortes. Un premier travail empirique démontre que ces troismécanismes induisent de la variation d'histoire de vie entre cohortes, mais met également en évidence que les effets directs de la variabilité environnementale sur la qualité des individus interagissent de manière complexe avec des effets indirects sur l'intensité de la compétition entre individus. Au cours d'une deuxième étude empirique, nous analysons les processus et conséquences démographiques de ces interactions compétitives.Une élévation de la densité augmente la compétition trophique et pourrait également induire des réponses hormonales au stress social, ce qui ralentit la croissance corporelle et la reproduction. Un modèle stochastique démontre que cette densité dépendance de l'histoire de vie interagit avec les fluctuations stochastiques du sexe ratio pour façonner la dynamique d'extinction des petites populations de lézards. Ces prédictions seront affinées par l'analyse d'une troisième étude empirique impliquant une manipulation conjointe de la densité et du sexe ratio de la population. Nos résultats, intégrés dans le contexte général de l'écologie des populations, soulignent l'importance de prendre en compte la structure de la population et l'hétérogénéité de l'histoire de vie pour établir des prédictions fiables sur le devenir des petites populations et mettre en place des mesures de gestion efficaces. Keywords (in french) : effets cohortes, densité dépendance, structure d'âge, sexe ratio adulte, histoire de vie, système d'appariement, sélection sexuelle. accueil doctorants - Soutenances de thèse Tue, 26 Apr 2011 01:00:00 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/actualites/deux-doctorants-fdv-laureats-du-young-entrepreneurs-initiative.html Camille Delebecque et Xavier Duportet, deux doctorants Frontières du Vivant fondateurs d'Omeecs, start up en biologie synthétique viennent d'être déclarés lauréats du Young Entrepreneurs Initiative 2011.Communiqué CRI Paris 8 avril 2011 en pdf (docs/communique-CRI-Paris-080411.pdf)Porteurs du projet Omeecs, Xavier Duportet (Master AIV 2009, lauréat IGEM 2010, Doctorant FdV 2010) et Camille Delebecque (Master AIV 2008, doctorant FdV 2009) ont atteint la finale du 'Concours de Création d'Entreprises de Biotechnologies pour l'environnement, l'agronomie et l'industrie' (http://www.genopole.org/Le-concours.html) organisé par le Bioparc Génopole avec leur projet de start-up de biologie synthétique autour de la conception de nouveaux antifongiques à partir de champignons. Ce projet de start up Omeecs leur vaut également aujourd'hui d'être lauréats du concours « Young Entrepreneurs Initiative » (http://www.yeifrance.com) 2011 organisé par l'Ambassade de France aux Etats Unis. Xavier Duportet et Camille Delebecque sont deux ingénieurs agronomes diplomés d'AgroParisTech ayant suivi le Master Approches Interdisciplinaires du Vivant (AIV) et aujourd'hui doctorants en biologie synthétique : - Xavier Duportet en co-supervision entre le Massachussets Institute of Technology à Cambridge et l'INRIA à Paris Rocquencourt; - Camille Delebecque en co-supervision entre la Harvard Medical School à Boston et l'INSERM à Paris. Tous deux effectuent leur thèse scientifique à l'Ecole Doctorale 474 interdisciplinaire Frontières du Vivant (FdV). accueil cri - Actualités Fri, 08 Apr 2011 16:55:55 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-doctorants/soutenances-de-these/fdv-student-minale-ouethranis-phd-defense-25.03.2011.html Congratulations to our new doctor Minale Ouethrani's who graduated with the very honourable grade !Her thesis defense took place on March 25th 2011 in Agroparistech Centre de Paris Claude Bernard (http://www.agroparistech.fr/IMG/pdf/Site_Paris_revu.pdf), Thesis : Chemical contaminants in coffee: developpement of analytical methods and investigation of their bioavailabilityAbstract :Coffee brew is one of the most frequent drinks consumed in the world, but its health effectsare still in debate as it remains a heterogeneous complex matrix. Even though some of itsmajor constituents have a beneficial health effect (i.e polyphenols), toxic organiccontaminants are also present such as OTA, PAHs or acrylamide. The role of the gutmicrobiota in the metabolism of such contaminants has been often overlooked and is a crucialstep in risk assessment. After the development of a straightforward analytical method for thesimultaneous quantification of the targeted compounds using a semi-automated solid-phaseextraction procedure with HPLC-FLD analysis, we used in vitro methodologies to study themetabolism of coffee contaminants by the human gut microbiota. Batch cultures as well asSHIME experiments showed that the human gut microbiota is able to degrade OTA withformation of OTα and OTB (newly microbial metabolite identified in vitro) which can beconsidered as a detoxification pathway. Using the SHIME, we have also investigated theeffects of OTA and its association with coffee brew on the human gut microbiota bymonitoring the fermentation activity and the composition of the microbiota by TTGE andDGGE. Major fermentation shifts were observed during the coffee + OTA period throughouta more important production of SCFAs and a paralleled decrease in ammonium. While nomajor change was observed within the dominant bacterial populations, notable changes couldbe observed towards Lactobacillus and Bifidobacterium species. In particular, L. reuteri wasfound to be greatly reduced by OTA. Further research is needed to study the possibleconsequences on the host physiology. accueil doctorants - Soutenances de thèse Mon, 28 Mar 2011 01:00:00 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/accueil-cri/evenements/conference-with-katie-salen-at-the-cri-11/04/2011.html On 11/04/2011, we are happy to welcome Katie Salen , a game designer, animator, and design educator. She has taught at MassachusettsInstitute of Technology (MIT), the University of Texas at Austin, Parsons School of Design, New York University, etc... Katie Salen is the Executive Director of Institute of Play, which promotes game design as a non-traditional educational tool. In 2009, she helped launch Quest 2 Learn (Q2L), a new public school in Manhattan, New York City, for which she is the Executive Director of Design. Conference / discussion with Katie SalenMonday 11th April - 17h30 - 20h00CRI - room 2006 We will discuss together how games can change the way we think about education and how games could be implemented in our curriculums at CRI and in all the educational activities we're involved in as teachers, students or volunteers.More information :Wikipedia (http://en.wikipedia.org/wiki/Katie_Salen) : Institute of Play (http://www.instituteofplay.org) Quest 2 Learn (http://q2l.org) New York Times article (http://tinyurl.com/69qdayj) (Sept 2010)   accueil cri - Evénements Thu, 31 Mar 2011 01:00:00 +0100 http://www.aiv-paris.org/fr/ecole-doctorale-fdv/pips-symposium/paris-interdisciplinary-phd-symposium-2011’s-edition.html SHAPES IN LIVING SYSTEMSParis, 13-15 June 2011   PIPS location (docs/PIPS2011%20Location.pdf)Contact (mailto:symposium@fdv-paris.org)Facebook (http://www.facebook.com/group.php?gid=96155453970)Please consult the Fondation Bettencourt-Schueller (http://www.fondationbs.org/)Mairie de Paris (http://www.paris.fr)Fondation Pierre Gilles de Gennes (http://www.fondation-pgg.org/)ESPCI Paristech (http://www.espci.fr)Espace Pierre Gilles de Gennes (http://www.espci.fr/esp/) Ecole Doctorale FdV - PIPS Symposium Fri, 04 Mar 2011 14:31:13 +0100