Encadrants

	Ariel Lindner : CR1 INSERM, co-responsable du master AIV, diplômé du programme interdisciplinaire 'Amirim' de l'université Hébraïque de Jérusalem (Israël) avec une spécialisation en chimie, il a obtenu un Master puis un Doctorat en Chimie de l'Immunologie à l'Institut Weizmann des Sciences (Rehovot, Israël) pour son travail sur les anticorps catalytiques comme modèles d'enzymes, les changements conformationnels des anticorps et l'évolution dirigée. Après une période de recherche à l'Institut Scripps en Californie (Etats-Unis), il obtient une bourse EMBO et Marie Curie pour poursuivre un post-doctorat à Paris et un poste de jeune chercheur à l'INSERM, il applique des approches en physique, chimie et biologie à l'étude de la variabilité individuelle entre clones. Il est professeur associé, faculté de médecine Paris Descartes (2008/9) et directeur des études du Centre de Recherches Interdisciplinaires (CRI).
	Pascal Hersen CR CNRS, co-responsable du master AIV, est ancien élève de l'Ecole Normale supérieure de Lyon, agrégé de sciences Physique et Docteur en Physique de l'université Paris VII. Son parcours interdisciplinaire commence en thèse à travers l'étude de la dynamique et la morphogenèse des dunes de sable avant de se tourner vers le vivant lors de son séjour post-doctoral à l'université d'Harvard où Il étudie les propriétés dynamiques de chemins de signalisation modèle chez la levure S. cerevisiae. Il est actuellement chargé de recherche CNRS au laboratoire Matières et Systèmes Complexes de l'université Paris VII - Diderot et ses recherches portent sur l'étude de l'adaptation dynamique de systèmes biologiques à des fluctuations environnementales. Il participe à l'organisation et aux enseignements du Master AIV.
	Stephane Douady, diplômé de l'ENS, d'un master et d'un doctorat de Physique de l'Université Pierre et Marie Curie (Paris VI), il est actuellement chercheur du CNRS à l'ENS et à l'Université Paris Diderot (Paris VII). Il a reçu la médaille d'argent du CNRS pour son travail sur de nombreux phénomènes naturels comme la phyllotaxie, les avalanches et les instabilités en milieu granulaire, le chant des dunes, la nervation et le déploiement des feuilles, etc. qu'il étudie à la fois par le biais d'approches expérimentales et par la modélisation.
	Annemiek JM Cornelissen . Annemiek JM Cornelissen, chercheur titulaire au CNRS, a obtenu son diplôme de maîtrise ès sciences et son doctorat au département de génie mécanique à l'Université Technologique de Delft (Pays-Bas). Pour sa thèse de maîtrise, elle a étudié l'effet d'une contrainte mécanique du tissu cardiaque sur le débit sanguin coronaire. Il s'agissait d'un projet interdisciplinaire en collaboration avec le département de recherche cardiovasculaire de l'Université Johns Hopkins (Baltimore, USA) et le département de physique médicale de l'Université d'Amsterdam. Elle a continué ce travail pour sa thèse de doctorat pour laquelle elle a en outre développé des modèles mathématiques afin de comprendre le contrôle du flux sanguin dans la microcirculation coronaire. Son travail post-doctoral sur les réseaux de tumeurs microvasculaires à la Charité Universitätsklinikum à Berlin (Allemagne) a été soutenu par une bourse Marie Curie. Elle est arrivée en France avec une bourse de l'ARC pour étudier la formation de réseaux vasculaires au département de physique de l'Université de Rennes. Actuellement, elle travaille au laboratoire Matière et Systèmes Complexes à Paris pour étudier les aspects physiques impliqués dans la morphogenèse vasculaire, en appliquant approche expérimentale et modélisation.
	David Tareste : INSERM tenured researcher, has a Bachelor of Science in Fundamental Physics and a Master Degree in Physico-Chemistry from Orsay University. He did his PhD at the Ecole Normale Superieure (Paris) on Adhesion Physics and his Postdoc at Columbia University (New York) on Cellular Biophysics, and more specifically the biophysics of neurotransmitter release. He is currently working at the Institut Jacques Monod (Paris) on the biophysical mechanisms of intracellular membrane fusion using in vitro reconstitution strategies and various quantitative experimental approaches (e.g. fluorescence spectroscopy, optical imaging, micromanipulation, force measurements).
	Timo Betz. Timo Betz est un chercheur titulaire au CNRS, travaillant sur la mécanique des cellules et la motilité cellulaire à l’unité Physico-Chimie de l’Institut Curie à Paris. Après avoir terminé un master au Centre de Dynamiques Non-linéaires à l’Université du Texas à Austin, il a reçu un doctorat en physique de l’Université de Leipzig en Allemagne, où il a travaillé sur les forces et dynamiques de l’actine impliquées dans la croissance neuronale. Il s’intéresse en particulier aux mécanismes de la cellule de base qui permettent à la cellule de contrôler et modifier ses propriétés mécaniques. En étroite collaboration avec des théoriciens et des biologistes, il tente de d'élaborer des descriptions physiques pour modéliser les processus complexes de non-équilibre qui contrôlent les cellules vivantes.
	Gregory Batt. Gregory Batt est chargé de recherches (CR1) à l'INRIA. Il a d'abord étudié la biologie moléculaire et cellulaire (maîtrise à l'ENS Lyon), puis l'informatique (master à l'ENS Lyon et thèse à l'INRIA/Université de Grenoble). Ses recherches visent principalement à développer des méthodes mathématiques et des outils informatiques pour l'analyse de la dynamique des systèmes biologiques au niveau moléculaire et cellulaire. Il s'intéresse notamment à l'analyse des réseaux de régulations géniques, avec des applications à la biologie systémique et synthétique, à la conception de tissus cellulaires, et au contrôle de processus biomoléculaires au niveau de la cellule individuelle. Gregory Batt est membre de l'équipe Contraintes du centre de recherche INRIA Paris-Rocquencourt.
	Mathieu Piel. Matthieu Piel est un jeune chef d'équipe à l'Institut Curie, en charge du groupe 'Biologie systémique de la division et de la polarité cellulaire'. Après une formation de physicien (Ecole Polytechnique et DEA de Physique des liquides), il a effectué sa thèse dans un laboratoire de biologie cellulaire, dirigé par Michel Bornens, et s'est intéressé au cytosquelette des cellules. Il a ensuite fait un post-doctorat dans le laboratoire de Andrew Murray à Harvard, pendant lequel il a étudié la polarité des levures de boulanger pendant la conjugaison (accouplement des cellules de levure). Dans le cadre de ce projet, il a mis en place des outils de micro-fluidique pour générer des gradients stables de molécules sur les cellules, en collaboration avec le laboratoire de Geaorge Whitesides. De retour en France sur un poste CNRS à l'Institut Curie, Matthieu a continué à travailler sur des questions reliées à la polarité cellulaire, en combinant microscopie sur cellules vivantes et control quantitatif de l'environnement grâce à des outils micro-fabriqués, comme le micro-patterning et la micro-fluidique.
	Vincent Danos. Vincent Danos est Directeur de Recherches au CNRS (Paris, laboratoire PPS), professeur à l'Université d'Édimbourg, membre extérieur du Santa Fe Institute, et également professeur invité à la Harvard Medical School (laboratoire de Fontana). Dans le cursus AIV, il enseigne la CompBio 2 avec Jean Krivine et Jérôme Féret. Ce cours complète le cours CompBio1 de Grégory Batt et introduit des formalismes à base de règles pour la modélisation des réseaux biomoléculaires combinatoires. Il est intéressé par les langages de programmation et de modélisation spécifiques a un domaine, et ceci principalement, mais pas uniquement, dans le contexte de la biologie systémique et synthétique. Ses intérêts vont plus généralement aux approches formelles de systèmes complexes, où se rejoignent la syntaxe, la dynamique et les propriétés d'apprentissage de ces systèmes. Sa méthodologie est basée sur les mathématiques.
	Pierre-Yves Bourguignon. Formé initialement à l'ingénierie statistique, Pierre-Yves Bourguignon a commencé à développer des méthodes statistiques pour l'analyse des séquences biologiques durant ses études doctorales au sein du laboratoire Statistique et Génome, puis du groupe "Computational Systems Biology" du Génoscope/CEA. Il est à présent post-doctorant dans le cadre du programme joint CNRS/MPG en "Systems Biology". Sa recherche s'articule autour de trois centres d'intérêt : l'analyse des signaux présents dans les régions non-codantes de l'ADN, l'intégration de données hétérogènes dans les modèles du métabolisme à l'échelle de la cellule, ainsi que l'exploration du paysage fonctionnel des séquences synthétiques. En 2010, il a fondé l'Ouvroir de Génétique Potentielle (Ougepo) avec Philippe Marlière.

Bien d'autres chercheurs sont associés au programme de formation du Master AIV : François Amblard, Samuel Bottani, Jean-Christophe Thalabard, Emmanuel Farge, Khashayar Pakdaman, Richard-Emmanuel Eastes, Matteo Merzagora.